Das Institut für Angewandte Forschung (IAF) ist das zentrale Forschungsinstitut der Hochschule Furtwangen. Es führt mittel- und langfristige Forschungsprojekte durch.

Angewandte Forschung ist ein wesentliches Profilelement der heutigen Fachhochschulen. Neben der auftragsgebundenen Forschung und Entwicklung für Unternehmen, werden auch Projekte bearbeitet die durch Bundes- wie auch Landesmittel gefördert werden. Viele Projekte entstehen dabei in einem interdisziplinären Umfeld mit anderen Forschungspartnern (Verbundforschung). Dies ermöglicht dem IAF mit namhaften Universitäten, Fachhochschulen und Forschungsinstituten zusammen zu arbeiten und so im internationalen Wettbewerb zu bestehen. Forschung hat heute im Zusammenhang mit den bereits etablierten Masterstudiengängen an der Hochschule Furtwangen an Bedeutung gewonnen um die Aktualität der Lehre zu halten. Die Forschung an der Hochschule Furtwangen gliedert sich in Schwerpunkte , die von der Mikrosystem-, Produktions-, Oberflächen- , Umweltsystem- und der Medizintechnik über webbasierte Infrastrukturen und Anwendungen bis zur Innovations- und Genderforschung reichen.

Im Zuge der aufkommenden Verbundforschung wurde das Kompetenzzentrum für Mikrotechnik und Systemintegration, ZeMiS, aufgebaut. Das Zentrum wird durch das Land Baden-Württemberg unterstützt. Durch das ZeMiS wird die Forschung nicht nur an der Hochschule Furtwangen betrieben. Durch den Zusammenschluss mehrerer Hochschulen und Forschungseinrichtungen kann so eine Kompetenz aufgebaut werden, die die Bearbeitung weitaus größerer und komplexerer Projekte ermöglicht. Nach Außen hin arbeitet das ZeMis als eine Institution und bietet so klein- und mittelständischen Unternehmen Forschung und Entwicklung aus einer Hand.

Im Forschungsauftrag der Fachhochschulen ist insbesondere der Gesichtspunkt des Transfers von Forschungsergebnissen und wissenschaftlichen Erkenntnissen für KMU enthalten. Das IAF wird diesem Auftrag durch die angebotenen Kompetenzen als Dienstleister gerecht.

Ein quantitativer Massstab für die Forschungsleistungen sind die Drittmittelaufkommen im Bereich der Forschung. Im Vergleich mit anderen Fachhochschulen Baden-Württembergs nimmt die Hochschule Furtwangen einen guten Platz ein. Im Jahre 2009 wurde in 170 Veröffentlichungen und Vorträgen auf z.T. internationalen Konferenzen über die Forschungsergebnisse berichtet. In die Forschungsprojekte waren über Studien-, Bachelor- und Masterabeiten  stets auch zahlreiche Studierende in die Forschungsaktivitäten eingebunden.